转录辅助因子对不同类型的整体启动子具有特异性

2021-12-13 02:34:35 来源:

RNA辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与内含子间传递调控线索，是RNA激活和突变表达的架构效应；也。虽然已断定某些COF比其他COF愈来愈偏好某些内含子并不一定，但是各不大致相同COF对各不大致相同内含子推测出的内在依赖性的程度尚不清楚。在一项原先分析中所，来自奥地利维也纳动；也中所心分子病理学分析所的分析工作人员在黑腹臭虫S2线粒体中所使用数据采集内含子活性测定来筛选23个COF激活7.2万个候选架构内含子（core promoter， CP）的能力。相关分析结果于2019年5月15日Skype发表在Nature期刊上，学术论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些分析工作人员观察到架构内含子的差异激活，这得出结论COF与特定并不一定的架构内含子间长期存在着各不大致相同的可调偏好或者说“兼容（compatibilities）”。这些功能各不大致相同的架构内含子在TATA盒、下游内含子组件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等存留的基因序列组件上差别地掺入，并在内源性位点上推测出各不大致相同的染色质连续性。值得注意的是，这些架构内含子并不一定在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上长期存在各不大致相同的相对数量级，这得出结论这些组蛋白修饰确实必需区分反式可调因子而不是内含子和增强子并不一定的卤代烃可调组件。这些分析工作人员断定在人线粒体和另外两种臭虫线粒体中所断定了各不大致相同COF-架构内含子兼容的长期存在。为此，他们发现了分别偏好TATA盒和CpG岛内含子的COF。COF和架构内含子间的各不大致相同兼容必需解释各不大致相同的增强子如何依赖性地激活各不大致相同组的突变、大致相同突变内的可变内含子（alternative promoter）和大致相同内含子内的各不大致相同RNA起始位点。综上所述，COF-架构内含子兼容确实是臭虫和人类等各不大致相同；也种中所各不大致相同RNA程序的基础。值得注意中有：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]